W Krakowie w szkołach podstawowych, gimnazjach i szkołach ponadgimnazjalnych funkcjonują gabinety profilaktyki i pomocy przedlekarskiej, w których opiekę nad uczniami sprawują pielęgniarki środowiska nauczania i wychowania. Świadczenia w zakresie medycyny szkolnej realizowane są na podstawie kontraktów zawartych z Narodowym Funduszem Zdrowia. W czerwcu 2005 weszło w życie Zarządzenie Nr 1088/2005 Prezydenta Miasta Krakowa w sprawie zasad organizacji medycyny szkolnej w samorządowych szkołach podstawowych, gimnazjach i szkołach ponadgimnazjalnych na terenie Gminy Miejskiej Kraków na lata 2005-2006.