Szkoła Podstawowa nr 97 im. Joachima Lelewela w Krakowie jest jednostką budżetową prowadzoną przez Gminę Miejską Kraków. Szkoła jest jednostką budżetową nieposiadającą osobowości prawnej.
Organem prowadzącym Szkołę jest Gmina Miejska Kraków.
Organem sprawującym nadzór pedagogiczny jest Małopolski Kurator Oświaty w Krakowie