Decyzją Komisji Konkursowej w kategorii Oświata - Miasta na prawach powiatu, Urząd Miasta Krakowa zajął w finale konkursu „Samorządowy Lider Zarządzania" II miejsce za projekt „Platforma Edukacyjna". Rozwiązanie użytkowane przez pracowników Wydziału Edukacji oraz pracowników oświaty krakowskiej zostało docenione jako narzędzie innowacyjne, opracowane i skutecznie wdrożone dla poprawy jakości szeroko rozumianego zarządzania oświatą w Gminie Miejskiej Kraków.
29 października 2009 r. na VII ogólnopolskim konkursie PFRON na najlepszy projekt jednostki samorządu terytorialnego szczebla gminy i powiatu na rzecz osób niepełnosprawnych RÓWNE SZANSE RÓWNY DOSTĘP Urząd Miasta Krakowa otrzymał wyróżnienie za projekt „Biuletyn Informacji Publicznej Miasta Krakowa przyjazny osobom niepełnosprawnym". Nagrodę odebrał Pełnomocnik Prezydenta Miasta Krakowa ds. Osób Niepełnosprawnych Bogdan Dąsal. Dyplom wyróżnienia - BIP Miasta Krakowa przyjazny osobom niepełnosprawnym
Podczas Międzynarodowych Targów Turystycznych w Lugano (Szwajcaria) 30 października 2009 r. Urząd Miasta Krakowa otrzymał Swiss Tourism Awards 2009 (Szwajcarską Nagrodę Turystyczną) w kategorii Cultural Destination (Miasto Kultury) jako „City wrapped in legend, that combines tradition with modernity". („Miasto legend, łączące tradycję z nowoczesnością"). Nagroda została przyznana przez przedstawicieli szwajcarskiej branży turystycznej oraz dziennikarzy zorientowanych w wymagającym rynku szwajcarskiej turystyki.
W ramach tegorocznej konferencji CIVITAS FORUM 2009 Kraków otrzymał wyróżnienie - dyplom, jako jedno z miast aplikujących do nagród CIVITAS. W treści wyróżnienia Komisja Europejska stwierdziła m.in., że: „Kraków otrzymuje wyróżnienie, jako miasto wdrażające działania CIVITAS, za wyjątkowe osiągnięcia na polu wdrażania polityki transportu miejskiego. Poprzez wyraźnie wsparcie polityczne, ciągłą konsultację z ekspertami oraz lokalnymi interesariuszami, Kraków z sukcesem zaplanował, wdrożył i ocenił swoje działania w zakresie transportu miejskiego...(...). Jako nominowanego do „kategorii I" nagród CIVITAS, Komisja Europejska wyróżnia Kraków jako jedno z najlepszych miast w Europie w tworzeniu realnych zmian w jakości życia mieszkańców Europy".
10 lutego 2009 r. Krakowski program gospodarki odpadami został doceniony przez Komisję Europejską w ramach Europejskiej Kampanii mającej na celu podniesienie świadomości i zmianę sytuacji energetycznej „Energetyka Zrównoważona Środowiskowo dla Europy 2005-2008". Kraków jako jedyne miasto polskie zostało nominowane w prestiżowym konkursie za projekt wdrażania technologii odzyskiwania energii elektrycznej i cieplnej w wyniku produkcji biogazu w instalacjach do odgazowywania składowiska odpadów komunalnych.
O miano najlepszego projektu w dziedzinie zrównoważonej energii i transportu rywalizowało 631 programów z całej Europy, gdzie po wstępnej selekcji wybrano 251 projektów, a 25 zostało nominowanych, w tym Kraków.
Nagrody sportowe:
I miejsce w Igrzyskach Młodzieży Szkolnej w klasyfikacji powiatów Małopolskiego Współzawodnictwa Sportowego Dzieci i Młodzieży Szkolnego Związku Sportowego za rok szkolny 2008/2009
I miejsce w Gimnazjadzie w klasyfikacji powiatów Małopolskiego Współzawodnictwa Sportowego Dzieci i Młodzieży Szkolnego Związku Sportowego za rok szkolny 2008/2009
I miejsce w Licealiadzie w klasyfikacji powiatów Małopolskiego Współzawodnictwa Sportowego Dzieci i Młodzieży Szkolnego Związku Sportowego za rok szkolny 2008/2009
I miejsce w łącznej klasyfikacji powiatów Małopolskiego Współzawodnictwa Sportowego Dzieci i Młodzieży Szkolnego Związku Sportowego za rok szkolny 2008/2009
II miejsce w XV Sportowym Turnieju Miast i Gmin - Małopolska 2009 w kategorii miast i gmin ponad 100 tys. mieszkańców
Ponadto Urząd Miasta Krakowa otrzymał dyplom za zajęcie III miejsca w rankingu inwestycyjnym samorządów za lata 2006-2008 w kategorii miasta wojewódzkie oraz statuetkę „Inwestycje 2009".
W tradycyjnych wyborach organizowanych przez portal internetowy Maratony Polskie na najlepsze biegi roku w Polsce, VIII Cracovia Maraton otrzymał Certyfikat Jakości - Złoty Bieg 2009. Jest to już trzecie kolejne wyróżnienie organizowanego od 2002 roku maratonu krakowskiego.
Gmina Miejska Kraków otrzymała nagrodę Eko Prix (150 tys. zł) w konkursie organizowanym przez Wojewódzki Fundusz Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Krakowie, na „Ekologiczną gminę województwa małopolskiego oraz na najlepszy projekt z zakresu edukacji ekologicznej oraz propagowania działań proekologicznych i zasad zrównoważonego rozwoju realizowany przez organizacje pozarządowe".
W dniu 9 października 2009 r. w Ośrodku Wellnes w Czorsztynie w ramach Małopolskich Obchodów Światowego Dnia Turystyki nastąpiło rozstrzygnięcie X plebiscytu „Wielkie Odkrywanie Małopolski 2009". W plebiscycie tym, głosami czytelników „Gazety Krakowskiej" projekt kulturalny „Krakowskie Noce" otrzymał wyróżnienie w kategorii Wydarzenie. W imieniu Urzędu Miasta Krakowa wyróżnienie odebrała pani Barbara Turlejska - Zastępca Dyrektora Wydziału Kultury i Dziedzictwa Narodowego.
Kraków zajął w 2009 r. I miejsce w rankingu miast na prawach powiatu, organizowanym przez Związek Powiatów Polskich. Ranking obejmował następujące obszary: działania proinwestycyjne i prorozwojowe, podnoszenie jakości obsługi mieszkańca i funkcjonowania jednostki samorządu terytorialnego, rozwój społeczeństwa informacyjnego i obywatelskiego, promocja rozwiązań ekoenergetycznych, proekologicznych i prozdrowotnych, współpraca krajowa i międzynarodowa, działania promocyjne.