Do zakresu działania Referatu ds. finansów i kontrolingu (IT-03-1) należy:
1) realizacja zadań związanych z budżetem Centrum w zakresie:
a) zbiorczego planu budżetu,
b) harmonogramu realizacji wydatków i dochodów,
c) rozliczania finansowego zaciąganych zobowiązań,
d) monitorowania i analiz dotyczących realizacji budżetu,
e) wniosków dotyczących zmian w budżecie,
f) sprawozdań z realizacji budżetu;
2) realizacja spraw związanych z gospodarowaniem składnikami majątku w Centrum, likwidacją i utylizacją majątku komórek organizacyjnych UMK w obszarze informatyki;
3) monitorowanie procesu realizacji umów zawieranych przez Centrum i rozliczanie kar umownych dla umów nienależycie wykonanych;
4) rozliczanie usług świadczonych przez Centrum dla miejskich jednostek organizacyjnych GMK.