Statuetka „Lider Oracle 2006” za konsekwentne wprowadzanie najnowocześniejszych rozwiązań IT w służbie mieszkańców.
Nagroda „Infinity – Forbes HP Intel” za dynamiczny rozwój w oparciu o efektywne wykorzystanie technologii IT, wręczona podczas konferencji FORBES HP Integrity Business Forum.
Certyfikat uczestnictwa w akcji PRZEJRZYSTA POLSKA (prowadzonej przez „Gazetę Wyborczą” przy wsparciu Fundacji Agory, Polsko-Amerykańskiej Fundacji Wolności, Fundacji im. Stefana Batorego, Fundacji Rozwoju Demokracji Lokalnej, Banku Światowego oraz Centrum Edukacji Obywatelskiej) potwierdzający wykonanie zadań obligatoryjnych.
Certyfikat uczestnictwa w akcji PRZEJRZYSTA POLSKA potwierdzający wykonanie zadań fakultatywnych.
Urząd Miasta Krakowa jest laureatem XII edycji konkursu Małopolska Nagroda Jakości (2006 r.) w kategorii „Organizacje publiczne”.
CERTYFIKAT JAKOŚCI „ZŁOTY BIEG 2006” dla Cracovia Maraton (imprezy organizowanej przez Urząd Miasta Krakowa) – wyróżnienie zostało nadane dla udokumentowania doskonałej organizacji V CRACOVIA MARATON przez kapitułę serwisu internetowego „Maratony Polskie” oraz biegaczy z całego kraju (www.maratonypolskie.pl).
Nagroda w VI edycji Konkursu Europejskiej Rady Urbanistów (European Council of Spatial Planners) – Sewilla 2006 w kategorii planowanie miejscowe za plan zagospodarowania przestrzennego obszaru „Wzgórze św. Bronisławy”.
Nagroda III stopnia Ministra Budownictwa za wybitne osiągnięcia twórcze w dziedzinie planowania przestrzennego (miejscowy plan zagospodarowania przestrzennego obszaru otoczenia portu lotniczego Kraków – Balice).
Wyróżnienie przyznane przez Związek Miast Polskich w kategorii publikacja za serie wydawnicze „Śpij tanio w Krakowie” oraz „Dwa dni w Krakowie”.
Nagroda w konkursie „The 2006 World Leadership Award” w kategorii gospodarka i zatrudnienie za projekt „Rozwój turystyki w Krakowie”.
I nagroda na 9. Międzynarodowym Festiwalu Filmów Turystycznych TOUR FILM w Poznaniu za spot „Kapcie” zrealizowany na potrzeby ogólnopolskiej kampanii reklamowej „Kraków. Dowolny kierunek zwiedzania”.
III miejsce wśród miast wojewódzkich w ogólnopolskim rankingu inwestycyjnym samorządów 2003-2005, prowadzonym przez pismo samorządu terytorialnego „Wspólnota”.
Nagroda w konkursie Public Relations „Złote Spinacze 2006” organizowanym przez Związek Firm Public Relations w kategorii event za projekt „Smok z 650 tys. kapsli TYMBARK”.
Laureat VIII edycji Narodowego Konkursu Ekologicznego „PRZYJAŹNI ŚRODOWISKU” pod honorowym patronatem Prezydenta RP, w kategorii „Promotor ekologii” oraz w kategorii „Gmina przyjazna środowisku”. Urząd Miasta Krakowa otrzymał certyfikaty Przewodniczącego Narodowej Rady Ekologicznej oraz listy od Ministra Edukacji Narodowej i Ministra Środowiska.