Do zakresu działania Referatu Organizacyjnego (KM-06) należą sprawy:
1) prowadzenia Sekretariatu i obsługi administracyjno-biurowej Wydziału, obsługi systemu EZD PUW oraz elektronicznej skrzynki pocztowej Wydziału;
2) opracowywania wniosków do projektu budżetu Miasta w układzie zadań budżetowych, wprowadzania projektów planów budżetu oraz Mierników i Wskaźników do systemu informatycznego, sporządzania sprawozdań oraz koordynacja i nadzór nad realizacją budżetu Wydziału, według zadań i klasyfikacji budżetowej;
3) sporządzania harmonogramu wydatków i dochodów, dokonywania korekt oraz nadzór nad realizacją poszczególnych zadań;
4) opracowywania prognoz dochodów i wydatków Wydziału;
5) koordynowania prac dotyczących monitorowania czasu pracy dla potrzeb analizy pracy Wydziału;
6) prowadzenia ewidencji rachunków, faktur i umów, obsługa podsystemów GRU, WYBUD i WPBUD;
7) prowadzenia wydziałowego rejestru umów wydatkowych;
8) przygotowywania dokumentacji oraz projektów umów dotyczących zlecania wykonania zadań innym podmiotom, w tym w trybie ustawy o zamówieniach publicznych;
9) opracowywania planów zamówień publicznych Wydziału, wykonywania zadań koordynatora zamówień publicznych oraz obsługi aplikacji SOZP;
10) sporządzania analiz, zestawień i sprawozdań statystycznych w zakresie działania Wydziału;
11) opracowywania projektów zarządzeń, poleceń służbowych i pism okólnych Prezydenta oraz sporządzania informacji o ich wykonaniu;
12) opracowywania informacji o realizacji poleceń służbowych Prezydenta i Dyrektora Magistratu;
13) opracowywania projektów zarządzeń wewnętrznych, poleceń służbowych i pism okólnych Dyrektora Wydziału oraz kontroli ich wykonania;
14) opracowywania projektów upoważnień i pełnomocnictw Prezydenta, prowadzenia i aktualizacji wydziałowego rejestru udzielonych przez Prezydenta Miasta Krakowa upoważnień i pełnomocnictw;
15) koordynacji przygotowywania projektów kart usług/instrukcji postępowania określających tryb załatwiania spraw należących do kompetencji Wydziału, prowadzenia rejestru kart usług/instrukcji postępowania Wydziału;
16) prowadzenia księgi inwentarzowej środków trwałych dla wszystkich lokalizacji Wydziału oraz pozostałych środków dla lokalizacji określonej przez Dyrektora Wydziału lub osobę upoważnioną;
17) prowadzenia ewidencji sprzętu użyczonego dla realizacji zadań w zakresie wydawania uprawnień do kierowania pojazdami oraz rejestracji pojazdów, przeprowadzenia inwentaryzacji sprzętu użyczonego;
18) prowadzenia wydziałowego rejestru wniosków, interpelacji oraz postulatów posłów i senatorów dotyczących zadań Wydziału;
19) sporządzania zamówień na materiały biurowe, wyposażenie - poprzez internetowy system zamówień (ESZT), druki, środki trwałe, sprzęt oraz bilety komunikacji miejskiej, nadzór nad ich prawidłowym wykorzystaniem;
20) prowadzenia stanu zatrudnienia Wydziału;
21) załatwiania bieżących spraw kadrowych i socjalnych pracowników oraz prowadzenia ewidencji kart badań okresowych i terminowości ich wykonywania;
22) prowadzenia spraw osobowych pracowników Wydziału tj. zbioru zakresów czynności, listy obecności, książka wyjść służbowych, rejestracja krajowych wyjazdów służbowych;
23) sporządzania wniosków o wypłatę stałych i zmiennych składników wynagrodzeń;
24) przygotowania dokumentacji dotyczącej naboru na wolne stanowiska urzędnicze i kierownicze w Wydziale;
25) prowadzenia wydziałowego rejestru pieczęci urzędowych;
26) współpracy z Pełnomocnikiem Prezydenta Miasta Krakowa ds. Zintegrowanego Systemu Zarządzania według wymagań normy ISO 9001 oraz ISO 27001, realizacja zadań w tym zakresie;
27) koordynacji ws. przygotowywania materiałów i informacji prasowych, współpraca z komórką organizacyjną właściwą ds. kontaktów z mediami;
28) koordynacji zadań dotyczących weryfikacji i opracowywania danych do publikowania w Biuletynie Informacji Publicznej oraz Miejskiej Platformie Internetowej Magiczny Kraków (MPI), nadzór nad kompletnością informacji i aktualnością danych, dbałość o zapewnienie informacji wizualnej dla stron;
29) sporządzania projektów upoważnień do przetwarzania danych osobowych do pracy w zbiorach danych zgodnie z Polityką Bezpieczeństwa Informacji, obsługa aplikacji SEZAM,
30) koordynowania realizacji zadań wynikających z Polityki Bezpieczeństwa Informacji w Wydziale;
31) prowadzenia działań zmierzających do doskonalenia organizacji pracy Wydziału (zapewnienie sprawnego systemu informacyjnego, racjonalizacji obiegu dokumentów);
32) prowadzenia postępowań skargowych;
33) prowadzenia rejestru wniosków o udzielonych informacjach publicznych;
34) koordynacji działań komórek organizacyjnych Wydziału w zakresie przekazywania dokumentacji do Archiwum Zakładowego.