Do zakresu działania Referatu Kontroli Finansowej (CA – 08) należy:
opracowywanie rocznych planów kontroli wewnętrznej, w porozumieniu z Referatem Kontroli Organizacyjno-Prawnej;
kontrola finansowa w:
komórkach organizacyjnych Urzędu Miasta Krakowa, tj. wydziałach Urzędu Miasta Krakowa lub komórkach organizacyjnych wchodzących w skład Urzędu Miasta Krakowa na prawach Wydziału,
miejskich jednostkach organizacyjnych, tj. jednostkach organizacyjnych utworzonych przez Miasto w celu realizacji jego zadań, w tym instytucjach kultury, dla których Miasto jest organizatorem, niewchodzących w skład Urzędu Miasta Krakowa i niebędących spółkami prawa handlowego,
spółkach, na które Gmina Miejska Kraków wywiera decydujący bezpośredni wpływ na podstawie uprawnień wynikających z jej mienia lub upoważnienia udzielonego jej przez uprawniony podmiot, w szczególności:
posiada uprawnienie do powoływania lub odwoływania większości członków zarządu lub rady nadzorczej tej spółki, także na podstawie porozumień z innymi osobami,
dysponuje bezpośrednio większością głosów na zgromadzeniu, także jako zastawnik albo użytkownik, bądź w zarządzie spółki kapitałowej, także na podstawie porozumień z innymi osobami,
innych podmiotach wydatkujących środki finansowe przekazywane przez Gminę Miejską Kraków na realizację zadań publicznych;
nadzór nad realizacją zaleceń pokontrolnych w zakresie kontroli finansowej, a w uzasadnionych przypadkach przeprowadzanie kontroli sprawdzających realizację zaleceń pokontrolnych;
opracowywanie projektów wniosków lub zawiadomień do organów ścigania w przypadku, gdy wyniki kontroli finansowej uzasadniają podejrzenie popełnienia przestępstwa oraz formułowanie wymaganych przepisami prawa zawiadomień m.in. do Rzecznika Dyscypliny Finansów Publicznych w przypadkach stwierdzenia naruszenia dyscypliny finansów publicznych w kontrolowanych podmiotach;
weryfikowanie, na podstawie przekazanej przez komórki merytoryczne Urzędu Miasta Krakowa dokumentacji, wniosków do Rzecznika Dyscypliny Finansów Publicznych w związku ze stwierdzeniem naruszenia dyscypliny finansów publicznych, a następnie przedkładanie ich do podpisu Prezydenta Miasta Krakowa;
wykonywanie innych zadań zleconych przez Prezydenta Miasta Krakowa.