Do zakresu działania Referatu ds. Kwalifikacji Wojskowej, Prowadzenia Rejestrów i Biura Rzeczy Znalezionych (SA‑09) należy:
1) realizacja zadań wynikających z przepisów ustawy z dnia 11 marca 2022 r. o obronie Ojczyzny zastrzeżonych dla starosty, w tym: prowadzenie rejestru osób na potrzeby kwalifikacji wojskowej, które w danym roku kalendarzowym ukończyły lub ukończą 18 rok życia oraz organizacja kwalifikacji wojskowej;
2) wystawianie tytułów wykonawczych oraz wydawanie postanowień w postępowaniu egzekucyjnym prowadzonym w razie niestawienia się do kwalifikacji wojskowej lub do ćwiczeń wojskowych;
3) sporządzanie sprawozdań dla Małopolskiego Urzędu Wojewódzkiego;
4) współpraca z Wojskowymi Centrami Rekrutacji w zakresie informacji o osobach podlegających kwalifikacji wojskowej;
5) opracowywanie projektów uchwał Rady Miasta Krakowa w sprawie:
a) utworzenia Społecznej Straży Rybackiej,
b) uchwalenia regulaminu Społecznej Straży Rybackiej;
6) wydawanie kart wędkarskich i łowiectwa podwodnego;
7) wydawanie zezwoleń na:
a) przegradzanie sieciowymi rybackimi narzędziami połowowymi więcej niż połowy szerokości łożyska wody płynącej,
b) ustawianie sieciowych rybackich narzędzi połowowych na wodach śródlądowych żeglownych na szlaku żeglownym lub w bezpośrednim jego sąsiedztwie;
8) rejestracja jachtów i innych jednostek pływających o długości do 24 m;
9) wydawanie legitymacji strażnikom Społecznej Straży Rybackiej w Krakowie;
10) wydawanie decyzji administracyjnych w sprawie zatwierdzenia regulaminu strzelnicy;
11) wydawanie zezwoleń na posiadanie i hodowanie chartów lub ich mieszańców;
12) realizacja zadań wynikających z przepisów o rzeczach znalezionych, zastrzeżonych dla starosty, w tym: prowadzenie Biura Rzeczy Znalezionych oraz obsługa organizacyjna Zespołu ds. oceny przydatności rzeczy znalezionych przejętych na własność Miasta Krakowa miasta na prawach powiatu;
13) wydawanie decyzji w sprawie pozwolenia na sprowadzenie zwłok lub szczątków ludzkich z obcego państwa;
14) wydawanie decyzji w sprawie przekazania zwłok publicznej uczelni medycznej lub publicznej uczelni prowadzącej działalność dydaktyczną i badawczą w dziedzinie nauk medycznych do celów naukowych;
15) nadzór nad powierzonym sprzętem użyczonym do realizacji zadań zleconych z zakresu administracji rządowej.