Do zakresu działania Referatu ds. Współpracy z Organizacjami Pozarządowymi (SZ-05) należy:
1) przeprowadzanie otwartych konkursów ofert oraz innych trybów zlecania zadań publicznych do realizacji organizacjom pozarządowym w ramach działania Referatu;
2) zawieranie i obsługa umów zlecających realizację zadań publicznych organizacjom pozarządowym, umów w zakresie realizowanych działań przez Referat, oraz rozliczanie przekazanych środków finansowych;
3) współpraca z Radami i Zarządami Dzielnic w zakresie realizacji zadań Dzielnic;
4) opiniowanie wniosków o powołanie Komisji Dialogu Obywatelskiego oraz współpraca z powstałymi Komisjami Dialogu Obywatelskiego;
5) przygotowywanie i koordynowanie realizacji programów współpracy samorządu Miasta Krakowa z organizacjami pozarządowymi oraz innymi podmiotami prowadzącymi działalność pożytku publicznego;
6) przygotowanie materiałów we współpracy z komórkami organizacyjnymi Urzędu Miasta Krakowa oraz miejskimi jednostkami organizacyjnymi i opracowanie sprawozdań z realizacji programów współpracy Gminy Miejskiej Kraków z organizacjami pozarządowymi oraz innymi podmiotami prowadzącymi działalność pożytku publicznego;
7) współpraca z organizacjami pozarządowymi, komórkami organizacyjnymi Urzędu Miasta Krakowa oraz innymi podmiotami prowadzącymi działalność na rzecz rozwoju organizacji pozarządowych;
8) koordynacja realizacji zarządzenia Prezydenta Miasta Krakowa dotyczącego współpracy Gminy Miejskiej Kraków z organizacjami pozarządowymi i mieszkańcami, w zakresie wzmacniania społeczeństwa obywatelskiego oraz usprawnienia przepływu informacji zewnętrznej i wewnętrznej dotyczącej tej współpracy, w tym współpraca z koordynatorami ds. współpracy komórek organizacyjnych Urzędu Miasta Krakowa oraz miejskich jednostek organizacyjnych;
9) koordynowanie realizacji zarządzenia Prezydenta Miasta Krakowa w sprawie wprowadzenia w Gminie Miejskiej Kraków elektronicznego generatora wniosków ofertowych i regulaminu jego funkcjonowania, w tym przekazywanie zgłoszeń miejskich jednostek organizacyjnych do Administratora Technicznego (IT) ;
10) przygotowywanie analiz, raportów, rekomendacji w zakresie współpracy Urzędu Miasta Krakowa z organizacjami pozarządowymi;
11) monitorowanie udzielania dotacji dla organizacji pozarządowych przez wszystkie komórki organizacyjne Urzędu Miasta Krakowa, w tym prowadzenie przeglądu procesu związanego z udzielaniem dotacji podmiotom zewnętrznym;
12) upowszechnianie informacji na temat zasad tworzenia i funkcjonowania organizacji pozarządowych oraz pomoc we wzmacnianiu ich struktur;
13) koordynacja i realizacja zadania związanego z prowadzeniem punktów nieodpłatnej pomocy prawnej na podstawie ustawy z dnia 5 sierpnia 2015 r. o nieodpłatnej pomocy prawnej, nieodpłatnym poradnictwie obywatelskim oraz edukacji prawnej oraz realizacja umów zawartych z radcami prawnymi, adwokatami i organizacjami pozarządowymi w tym zakresie;
14) ogłaszanie i rozstrzyganie konkursu ofert na prowadzenie przez organizacje pozarządowe punktów nieodpłatnej pomocy prawnej na podstawie ustawy z dnia 5 sierpnia 2015 r. o nieodpłatnej pomocy prawnej, nieodpłatnym poradnictwie obywatelskim oraz edukacji prawnej;
15) konsultowanie z Krakowską Radą Działalności Pożytku Publicznego lub z organizacjami pozarządowymi projektów uchwał i aktów prawa miejscowego w dziedzinach dotyczących działalności statutowej tych organizacji;
16) obsługa administracyjno-biurowa działań Krakowskiej Rady Działalności Pożytku Publicznego;
17) obsługa kancelaryjno-biurowa oraz merytoryczna Pełnomocnika Prezydenta Miasta Krakowa ds. Organizacji Pozarządowych;
18) realizacja zadań związanych z koordynowaniem dziedziny zarządzania Społeczeństwo Obywatelskie (D);
19) udział w pracach Małopolskiego Komitetu Rozwoju Ekonomii Społecznej;
20) prowadzenie korespondencji z sądem w sprawach dotyczących dokumentów rejestrowych stowarzyszeń;
21) nadzór formalno-prawny nad fundacjami i stowarzyszeniami za wyjątkiem Fundacji Miejski Park i Ogród Zoologiczny w Krakowie;
22) realizacja przepisów ustawy z dnia 1 marca 2018 r. o przeciwdziałaniu praniu pieniędzy oraz finansowaniu terroryzmu w zakresie ustawowego nadzoru nad fundacjami i stowarzyszeniami;
23) prowadzenie ewidencji stowarzyszeń zwykłych nieposiadających osobowości prawnej, ewidencji terenowych jednostek organizacyjnych stowarzyszeń;
24) realizacja i koordynacja organizacji konkursu pn. „Filantrop Krakowa” na podstawie uchwały nr LXXXI/1966/17 Rady Miasta Krakowa z dnia 30 sierpnia 2017 r. w sprawie ustanowienia tytułu Filantrop Krakowa;
25) prowadzenie portalu ngo.krakow.pl oraz innych kanałów komunikacyjnych dla organizacji pozarządowych;
26) współpraca z Radami i Zarządami z Dzielnic w zakresie inicjatyw społecznych;
27) realizacja akcji „Podzielmy się ciepłem”;
28) kształtowanie polityki społecznej oraz informacyjno-promocyjnej, inicjowanie i organizowanie wydarzeń i kampanii w zakresie zadań Referatu;
29) koordynacja zarządzenia Prezydenta Miasta Krakowa ws. „Procedury zawierania partnerstw projektowych pomiędzy Gminą Miejską Kraków a organizacjami pozarządowymi”.